中華醫學會於1915年創立於上海，1949年政府遷台後，由第一任劉瑞恆理事長邀集在台醫界人士共籌復會。因此於1951年在台復會後，當時因經費籌募有限，故在1954年3月才開始發行復刊後的第一卷第一期之中華醫學雜誌季刊，並由顏智鍾擔任首位主編。期間經過許多前輩們的努力，目前發行至今以已至八十八卷。

         中華醫學會雜誌自2008年1月份開始即被國際知名之科學文獻引用指標 (Science Citation Index Expanded，簡稱SCIE)收錄在一般醫學類，是國內少數專業期刊進入SCIE中的，自2008年1月份被SCIE收錄後，中華醫學會雜誌的引用次數及Impact Factor已正式開始被計算，初始2011年Impact Factor為0.678(在Medicine，General & Internal類別中)。目前 Impact Factor 為1.9。

• 本雜誌E化於2008年5月正式上線，原網址：http://ajws.elsevier.com/jcma。
• 2010年10月份完整正式啟用EES系統，網址為：http://ees.elsevier.com/jcma/。
• 2019年起由Wolters Kluwer(LWW)負責E化線上出版，目前JCMA之投審稿系統(EM)網址為： https://www.editorialmanager.com/jcma/